Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HALP42357 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HALP42357 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HALP42357 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HALP42357 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HALP42357 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HALP42357 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HALP42357 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms