Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms