Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms