Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1P31415 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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