Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD1P28340 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms