Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms