Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms