Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF4P18085 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF4P18085 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF4P18085 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF4P18085 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms