Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN1P18031 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms