Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms