Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms