Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HOXA3O43365 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HOXA3O43365 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HOXA3O43365 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HOXA3O43365 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HOXA3O43365 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HOXA3O43365 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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