Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms