Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms