Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms