Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms