Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTNAP2Q9UHC6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms