Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1BQ9UD71 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms