Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms