Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK13-1Q9NX77 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms