Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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UBQLN4Q9NRR5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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