Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms