Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms