Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms