Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms