Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms