Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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IFT27Q9BW83 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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IFT27Q9BW83 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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