Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms