Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf85Q96MD7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms