Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms