Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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