Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF34Q969K3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF34Q969K3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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