Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms