Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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UBXN4Q92575 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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