Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms