Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms