Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TTC29Q8NA56 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TTC29Q8NA56 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TTC29Q8NA56 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TTC29Q8NA56 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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