Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms