Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms