Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3H3Q8IVL6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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