Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms