Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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