Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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