Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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