Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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