Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SSX1Q16384 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms