Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms