Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms