Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms