Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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